在大海的中央黑洞的边缘，早在文明复兴之前，通天塔就已屹立在那里，就好像与从大海中央黑洞中升起又落下的太阳一样，是这个世界自在永有的事物。其历史远远早于所有现存最早的记载。它是什么，是某个神明的居所吗？还是某个外神的触须？抑或是前文明的造物？没人知道。人们站在它的脚下，看着通天塔的塔顶消失在云雾缭绕之间，显得人类一切功勋与成就都是那么的渺小。
从三百年前开始，来自各大陆的探索者就开始进入其中冒险，其中绝大部分都有去无回。从幸存者的口中，人们知道了不少有关通天塔的信息。
首先，通天塔其实是一座实心塔，所谓的通天塔的每一层，其实是一个个小空间。通天塔似乎是无穷无尽的，且每层并非按照线性排列，而是像迷宫一样错综复杂的连接在一起。没人知道通天塔的顶层在哪里；也有可能，寻找到顶层的探索者都没能离开通天塔。
通天塔中有很多不同的生物，它们之间有派系，会互相敌对，但无一例外都将探索者们视为入侵者。从通天塔内和通天塔生物的身上，探索者能找到神奇的矿物、植物，水平远超当下的魔法技术，关于前文明的只言片语；通天塔的最底部几层也已被成功开拓和开发，带来了丰厚的回报。这些都激励着一批又一批探索者进入通天塔更高层中冒险。
但是，通天塔内是极其危险的。通天塔内的生物对入侵者毫不手软，会杀死大部分的探索者，并将捕获的幸存探险者的禁锢和驯化。通天塔的主人还会分出分身，镇守在某些层级内，奴役失败的探索者；还有不少探索者被通天塔主人所诱惑，主动成为祂的爪牙。通天塔探索的路上因此更加艰险。

后来，有五名来自不同种族探索者，在对通天塔的探险中逐渐成名。她们是：巫妖“星尘”爱陀尼亚（去2页）、仙人“调魂匠”晚琊（去3页）、精灵“弓王”琳娜·厄朵拉（去4页）、半灵“生灵之墙”花岗寺（去5页）、欢魔“第五圣徒”尖晶石（去6页）。
在探索中，五人逐渐互相认识，并很快熟络起来。终于有一天，五位探索者聚集在一起，组成了一支只以登顶为目标的探索小队，向通天塔的顶端发起冲击。在历经千难万险之后，探索小队终于来到了通天塔的塔顶，见到了通天塔的主人：一个通身银白色、似男似女的人形。通天塔主人先是欢迎了这个世界上首先登顶的五人，并赞颂了探索小队五人的实力、毅力和运气。但想要得到奖励，探索者们就需要三次登上塔顶，这只是第一次。随后，通天塔的主人挥了挥手，五人的能力都被封印，装备物品也被收走，随后就被随机传送到了通天塔不同的角落当中。
但这难不倒这五位探索者。在奴化与不屈、忍耐与反戈、耐心与智慧之后，五人寻找魔法材料解除了身上的封印，寻找到了自己被剥夺的装备，并最终在登上塔顶之前汇合。探索小队在第二次登顶时，总算可以堂堂正正与通天塔的主人进行最终的决战。
这场惊天动地的战斗持续了七天七夜。最终，在五人的共同努力下，通天塔主人被打败了。可马上，在五人脑海中响起的声音就让她们知道，被打败的不过只是通天塔主人的化身，所谓通天塔其实是一整棵巨树的树干，祂的树冠笼罩了整个世界，将世界与世界之外隔绝开来，这才是通天塔主人的本体。
于是，通天塔主人再一次将五人的能力和装备夺走，将她们送回了自己的大陆。而这是五人第三次登上塔顶前的考验：与通天塔之间的交通已经停止，原因是各大陆都已经完全变样了：在巫妖大陆，人类贵族推翻了与他们共治大陆的巫妖评议会，将巫妖们贬为恶魔；在仙人浮陆，邪道宗门联盟打败了各正道宗门，瓜分了仙人浮陆；在精灵大陆，一直被各精灵王国压制在地底的“肉主”突破了封锁，祂的子嗣们征服了精灵大陆；在半灵列岛，贸易联盟用机器人兵团推翻了半灵诸国，将镇守生界与亡界之界线的防线划归直辖，通过将绝大部分人收归契约奴隶来提高效率和赚取利润；在欢魔山脉，回归派的“第三圣徒”方解石成为了欢魔教会的教皇，回归派将所有欢魔的身体关押，以迎回欢魔们的造物主，外神“傀儡主人”为最终目的。
面对黑暗笼罩下的世界，五人并没有气馁。首先是在巫妖大陆，爱陀尼亚团结了人类农民工匠与巫妖们，以及低阶土地贵族与不满的军功贵族，反抗人类贵族联盟的统治，最终在一场大会战后彻底打败了以班洛亚契大公为首的贵族势力。随后，爱陀尼亚协助建立的二族议会出兵，帮助花岗寺与起义的契约奴隶们、在贸易联盟的统治中靠边站的半灵家族们，一起推翻了贸易联盟的统治。与此同时，晚琊已经分化了邪道宗门之间的关系，挑起邪道宗门之间的战争，并联合正道宗门的幸存者们发起反攻。随后，晚琊、爱陀尼亚、花岗寺三人联手打败了已经吞噬了其它邪道宗门成员、已达半神境界的厉魂宗宗主厉成坤。
打败厉成坤后，二族议会、半灵、仙人合兵一处，向统治精灵大陆的肉主发起远征，协助厄朵拉的精灵反抗联军清剿肉主的子嗣，并在精灵大陆地底与肉主开始战斗。此时，在欢魔山脉，回归派与反回归派的内战也达到了白热化的程度；欢魔回归派的祈祷终于在通天塔的树冠上开出一条裂缝，迎来了外神傀儡主人的分身降临。就在外神分身如摧枯拉朽般摧毁了反回归派欢魔们的反抗时，祂却感受到了一股异常的能量波动：傀儡主人分身的气息被尖晶石引向肉主，祂无法忍受外神分身降临这种近乎挑衅的行为。受伤的肉主与傀儡主人分身在战斗中两败俱伤，探索小队的五人合力，将重伤的两尊神明斩杀。
世界就此太平。短暂的准备过后，探索小队第三次向通天塔的塔顶发起冲击。这一回，登塔的路程要更加艰险，战败的贵族残军、邪道宗门的余孽、逃亡的回归派欢魔、仍然忠于贸易联盟的战斗机器人兵团、以及肉主残存的子嗣们都撤入了通天塔中。这一次的登塔旅程，要比前两次更加困难。最终，在塔顶之前，班洛契亚大公，邪化半神厉成坤，肉主的核心残魂，贸易联盟机器人兵团中控单元，以及回归派欢魔教皇方解石，与探索小队的五人展开了决战。

探索小队还是战败了，她们淹没在源源不断的敌人攻势当中，并最终力竭被俘，倒在第三次登顶前的最后一刻。她们的敌人们在通天塔中休养生息了一段时间，随后冲出通天塔，再一次将世界征服。利用贸易联盟对灵魂的研究，结合厉成坤的控魂之术，以晚琊的调魂琴为工具，探索小队的五人在长久的施虐后心灵防线崩溃，彻底被洗脑，成为了她们敌人征服世界的兵器。
班洛契亚大公建立了一个帝国，巫妖再次被奴役，与穷苦的人类农民工匠一起。而“星尘”爱陀尼亚被制成了专属班洛契亚大帝所使用的，名为星器的便器。在班洛契亚皇朝的朝会上，星器永远立于班洛契亚大帝身侧，在大帝的命令下用星尘魔法击杀每一个忤逆大帝的逆臣。
邪道再次统一了仙人浮陆；并且这一回，再也没有什么内讧或者争吵了。厉成坤成为了邪道和浮陆唯一的统治者。所有的邪道宗门和散修，都要向他一个人宣誓效忠。而“调魂匠”晚琊如今是厉成坤的宠妃，琴妃。她时时刻刻跟随在厉成坤身边，一言不发，只是用她那拨动的琴弦拷问和虐杀所有反抗厉成坤的正道或邪道仙人。
精灵大陆再次沦陷，肉主的子嗣们统治着这片大陆。而在大陆的中央，沙漠中的长河边上，一座无与伦比的神庙再次被修建出来，用于供奉精灵们的主人；“弓王”琳娜·厄朵拉，如今的肉主神侍，用分身主持着这最雄伟的血肉神庙。肉主的本尊就位于神庙地下，在无边的肉海当中，肉主神侍的肉体淹没在无尽的触手当中。
贸易联盟机器人兵团返回了半灵列岛，那些隐藏起来的贸易联盟成员和支持者现身，会同机器人兵团一同再次征服并统治了半灵列岛。商业契约再次同出生证明一起，降临在每个新生半灵的身上。而在贸易联盟总部都市、总部大楼的架空中庭中，“生灵之墙”花岗寺被制成了人偶001，白天如同雕塑般矗立在中庭当中，夜晚为所有贸易联盟成员提供服务，昭示了反抗者的最终结局。
在欢魔山脉，第三圣徒方解石教皇回来了，欢魔教会重回回归派的统治。整个欢魔山脉变成了一座巨大的修道院，每一名欢魔都要诵念创造者的名字。而在欢魔山脉的巅峰、欢魔教会的大教堂中，“第五圣徒”尖晶石被砍去四肢放置在傀儡主人的巨型雕像的基座前，以首席祷者的身份永生永世为傀儡主人的降临祈祷。

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